在这种情况下，即使拥有中国乔丹胡卫东，球队的战斗力也是每况愈下，在1997年的全运会上，江苏男篮只胜一场，引起了江苏省体育局乃至省政府的震惊，而南钢方面自己也认识到，这样玩下去，恐怕结果会越来越糟糕，于是双方开始变更合作模式，由体院加强监管，包括主教练的指派、联赛休战期间的训练管理，大权都交回到体院手中。球队还进行了大换血，将沈震海等老将淘汰出队，二队的张成、胡雪峰、唐正东先后进入南钢男篮并成为主力。

这种半专业半职业的体制在后来没少被人诟病，但客观地说，这既是这座中庸气质城市的中庸选择，也是职业化进程中的无奈之举。

体制被确定下来后，新鲜血液的注入给这支球队带来了活力，球队也尝到了规范管理和系统训练的甜头，小将张成、胡雪峰、唐正东一出道便表现出了不俗的实力，但是在其后，球队开始显示出与这座城市共有的浮躁，几易其帅，徐强刚刚把球队带上正轨，高层便开始有更高的图谋，先是找来了韩国教练陈孝准，接着又换了台湾教头邱大宗，最后又搞出个主教练加执行教练模式。固然，陈孝准带来了更严格的管理和作风，邱大宗带来了多变的战术，主教练加执行教练也是对本土教练的培养，但几次易帅给球队带来的变化反而使这支球队迷失了方向，陈孝准走了，作风没了；邱大宗走了，战术没了……而在见证这支球队的浮躁过程中，你也能看到这个城市的浮躁。

尽管如此，2004年，球队还是凭借不错人员的配置，球队第一次杀入总决赛，但是在大好形势下，最终还是吃了作风不够强硬的亏，在大好形势下将冠军拱手让人。那一夜，南京球迷泪如雨下，在失望之极中，“假球说”被很多人当作愤懑与自慰的工具。

2005年是南京城市迅猛发展的一年，修地铁，房价飚升，而在这一年，球队的自信心也随着城市一起爆棚，有了上一年杀入总决赛的底子，又是主场作战，球队几乎认定冠军已是囊中之物，甚至在十运会开始前，就有人在讨论庆功事宜。当然，比赛准备工作做的也是十分充分，全封闭式训练，还请来宫鲁鸣作顾问。但结果出人意料，球队连决赛都没进入，在半决赛中就被八一淘汰。

这次失利带来的最大影响，一是胡卫东就此黯然退役，全身心去学习如何做教练，二是省体育局在后来成立省篮排球管理中心，球队和体院脱离关系，由省体育局直接管理，三是球队重省自身，不再不切实际地喊出冠军口号，也不在教练思路上折腾，铁下心来学习八一，学八一培养自己的队员和教练，学八一的铁军作风。尽管外界不断诟病职业化程度不高是球队无法更上一层楼的根本原因，但三点改变无一涉及俱乐部职业改进，相反，体育局的接管使半专业的味道更浓了。

在2005-2006赛季之前，南钢与球队合同到期，俱乐部赞助商同曦房产一度欲取南钢而代之，在败出竞争圈之后，同曦宣告不再赞助江苏南钢男篮，而是要建立自己的职业化俱乐部，从乙级联赛开始打起，此计划也得到了同曦所在的南京市江宁区政府大力支持，但是在风放出来之后，渐无声息，这固然与农民企业家的赌气有关，但也从一个侧面反映出在这里想要搞一个职业化的球队并非像说起来那样简单。

同曦退出赞助之后，南钢顺利签约此后，怪事再次出现了。江苏汇丰欲以500万一年的价格赞助南钢俱乐部，但在双方签合同之前，上海大华却以350万的价格捷足先登，弃500万而择350万，并非南钢俱乐部领导数学学得不好，乃是体制使然，大华为上海复星旗下企业，而南钢集团在之前的大型国有企业改制浪潮中也与复星合作成立了南京钢铁联合公司、其中复星是大股东，虽然南钢俱乐部不属于复星旗下，但复星通过给南钢集团施压让俱乐部完成了这次完全背离市场与逻辑常理的简单数学题。

一个城市的气质，一个大型国有企业的体制与命运，就这样，缩影在一支小小的球队身上。